आतंकियों के कदमों के निशां का पीछा कर एजेंसियां उत्तराखंड भी पहुंचती रहीं हैं। 90 के दशक से लेकर अब तक कई बार खालिस्तानियों का नेटवर्क ध्वस्त किया जा चुका है
आतंकी घटनाओं से कभी सीधे तौर पर उत्तराखंड का जुड़ाव नहीं रहा लेकिन आतंकियों के कदमों के निशानों का पीछा करते हुए देश की सुरक्षा एजेसियां यहां पहुंचती रहीं हैं। कोई यहां से नेटवर्क चलाने की फिराक में था तो कोई घटना के बाद यहां पनाह लिए हुए था। उत्तराखंड पुलिस ने सुरक्षा एजेंसियों के साथ मिलकर कई आतंकियों और इनके समर्थकों को ढूंढ निकाला
अब भी उत्तराखंड पुलिस ऐसे किसी देश विरोधी शख्स के लिए उत्तराखंड को शरणस्थली नहीं बनने देना चाहती है। लिहाजा सभी एजेंसियों के साथ मिलकर खुफिया जानकारियां लगातार इकट्ठा की जा रही हैं। 1980 के दशक में खालिस्तान आतंकवादियों से ऊधमसिंह नगर जिला भी प्रभावित था। उस वक्त यहां भी आतंकवादियों की सक्रियता हुआ करती थी। एक दशक से भी ज्यादा के समय तक पुलिस और आतंकियों में कई मुठभेड़ हुईं। कभी पंजाब पुलिस ने भी स्थानीय पुलिस के साथ मिलकर कई ऑपरेशन चलाए
